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# Ingénieur Informatique Data Management Eds H/F

- **Company:** Chu De
- **Location:** Poitiers, France (Remote available)
- **Salary:** €28,000.0
- **Contract:** Temporary contract
- **Skills:** Information Systems, Databases, Extract Transform Load (ETL), Linux, Python (Programming Language), SQL Databases, Technical Data Management Systems, Data Processing, Git, Information Technology, Data Management, Docker
- **Published:** October 15, 2026
- **Apply:** https://www.hellowork.com/fr-fr/emplois/84422119.html

## About the Role

Diplôme Bac +5 en en statistique, mathématiques appliquées ou informatique avec une orientation donnée de santé ;

 - Expertise en gestion de bases de données ;
 - Maîtrise du langage SQL ;
 - Maîtrise d'un langage de traitement des données (Python ou R);
 - Expériences dans les algorithmes de TAL et des métriques d'évaluation, notamment en reconnaissances d'entités nommées et en classification automatique de textes ;
 - Compétences en modélisation statistique appliquée aux trajectoires de santé (modèles de survie, régressions) ;
 - Connaissance de Git ;
 - Connaissance de Linux ;
 - Serait un plus :
 - Une expérience en épidémiologie clinique ou en intégration de cohortes longitudinales Une expérience dans le domaine de la santé
 - La connaissance de Docker
 - Rigueur, autonomie, sens de l'organisation.

Le (la) candidat(e) devra en outre avoir les qualités humaines et relationnelles adaptées au travail au sein d'une équipe composite, dynamique et pluridisciplinaire intégrant médecins, informaticiens, attachés de recherche clinique, chef de projet et gestionnaire administratif.

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 - Faire preuve d'un engagement fort au sein d'une structure hospitalière publique, ETL
SQL
Linux
Gestion des données
Git
Python
Autonomie
Gestion de base de données
Statistiques
Docker
Sens de l'organisation

## Description

Nous cherchons un(e) ingénieur data souhaitant travailler sur un projet ambitieux visant à exploiter de grands volumes de données pour enrichir les données des collections biologiques du CRB à partir de l'EDS et à faciliter leur exploitation statistique au service des projets de recherche...- Missions générales
Sous la responsabilité des coordonnateurs du CRB et de l'EDS, et en lien fonctionnel étroit avec les cliniciens responsables des collections biologiques, les principales missions seront de :

 - Participer au développement et à la maintenance des processus d'extraction, de transformation et de chargement (ETL) des données du système d'information vers i2b2 et OMOP, nécessaires aux besoins du CRB ;
 - Participer aux activités de data management des données pour les projets de recherche en lien avec le CRB (identification, structuration et intégration dans un eCRF des données de l'EDS nécessaires au projet) en coordination avec les cliniciens référents de chaque collection ;
 - Analyser les besoins et réaliser des développements spécifiques de traitement automatique de la langue pour les cas d'usage du CRB nécessitant de recueillir des informations mentionnées en texte libre ;
 - Interroger les données de l'EDS pour répondre à des études de faisabilité en lien avec le CRB.
 - Contribuer à l'analyse des trajectoires de santé des patients inclus dans les collections (évolution de paramètres cliniques et biologiques dans le temps, identification de la survenue d'événements de santé d'intérêt), au-delà du seul travail de structuration des données, via des approches de modélisation simple adaptées aux besoins des cliniciens.

L'objectif transversal est de reconstruire la trajectoire de santé des patients inclus dans les collections, de faciliter l'exploitation des échantillons biologiques associés, et ainsi de consolider les partenariats scientifiques et les candidatures aux appels d'offres nationaux et internationaux. Le poste s'appuiera en priorité sur les collections suivantes, tout en restant ouvert à d'autres collections du CRB :

 - Étude SURDIAGENE (1 470 patients, ~50 000 échantillons : sérum, plasma, ADN) : reconstruction des pentes de fonction rénale à partir des données longitudinales de l'EDS, identification de la survenue d'événements d'intérêt cardiovasculaires et rénaux d'intérêt pour la modélisation, structuration des données techniques des échantillons pour faciliter leur exploitation.
 - Collection Diabète (2 000 patients, ~10 000 échantillons : sérum, plasma, ADN, tissu) : mêmes objectifs de phénotypage longitudinal et de structuration des échantillons, en articulation avec les données cliniques de l'EDS. À terme, cette collection sera poolée avec SURDIAGENE pour constituer une cohorte unifiée, renforçant la puissance statistique des analyses de trajectoires.
 - Collection Obésité (2 000 patients, ~10 000 échantillons : sérum, plasma, ADN, tissu) : reconstruction de trajectoires de santé (notamment métaboliques et rénales), identification d'événements de santé d'intérêt, mise en qualité des données techniques des échantillons.
 - Collection AIGLE (~45 patients, 90 échantillons biopsies tissulaires) mise en qualité et structuration des données associées à ces échantillons,

Ces cas d'usage visent à améliorer le phénotypage des patients, à mieux organiser les données techniques associées aux échantillons pour en simplifier l'exploitation, et à renforcer l'attractivité de ces collections pour de futurs partenariats et appels à projets.

 - Participer à la réalisation d'analyses statistiques descriptives des données mises en qualité dans le cadre des cas d'usage CRB/EDS ;
 - Participer à la production d'indicateurs dans le cadre du système de management de la qualité et des certifications réglementaires relatifs au CRB ;
 - Dynamiser une communauté avec les autres ingénieurs en charge de l'exploitation des données des EDS et des CRB.

 - Nature du contrat et des conditions de recrutement