Postdoktorandin/Postdoktorand , Mathematisch-Naturwissenschaftlich-Technische Fakultät
Role details
Job location
Tech stack
Job description
- Modellierung und Simulation von Lipidsystemen und Lipid-Nanopartikeln (All-atom MD, constant-pH-Simulationen und coarse-grained Simulationen)
- Berechnung von Streusignalen aus Simulationsdaten und quantitativer Vergleich mit experimentellen Daten
- Anwendung von Enhanced-Sampling-Methoden sowie Entwicklung von Machine-Learning-Algorithmen zur Vorhersage von Streudaten für biomolekularer Systeme
- Betreuung von Übungen in Physik/Biophysik
Requirements
- Hochschulabschluss in Physik, Biophysik oder einem verwandten Fachgebiet
- Promotion in computergestützter oder theoretischer Physik bzw. Biophysik
- Fachkenntnisse in: Computersimulationen, Molekulardynamik-Simulationen, Machine Learning und High-Performance Computing
- Erfahrung mit Lipidsystemen oder Membransimulationen ist wünschenswert
- Kenntnisse von Streumethoden sind von Vorteil
- Sehr gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift
Benefits & conditions
mit 100 % TV-L E13, befristet für bis zu 2 Jahre.
Projektüberblick: Lipid-Nanopartikel (LNPs) gehören zu den vielversprechendsten Technologien um RNA-basierten Therapeutika in Zellen zu schleusen. Trotz ihrer biomedizinischen Bedeutung sind die molekularen Mechanismen, die den pH-abhängigen Strukturübergängen, Membranfusion und RNA-Freisetzung zugrunde liegen, bislang unzureichend verstanden. Ziel dieses Projekts ist es, die grundlegenden biophysikalischen Mechanismen aufzuklären, durch die ionisierbare Lipide das strukturelle und funktionelle Verhalten in ionisierbaren Lipidsystemen und Lipid-Nanopartikeln regulieren. Der Forschungsschwerpunkt liegt auf der Modellierung von Lipidsystemen und der Durchführung von Molekulardynamik-Simulationen (MD). Darüber hinaus umfasst das Projekt die Berechnung von Neutronen- und Röntgenstreusignalen aus Simulationen sowie deren quantitativen Vergleich mit experimentellen Daten.
Relevante Arbeiten: https://doi.org/10.1073/pnas.2310491120, https://doi.org/10.1063/5.0172552, https://doi.org/10.1039/d3nr00987d, * Exzellente und interdisziplinäre Forschung im Bereich biomolekularer Simulationen
- Enge Zusammenarbeit mit experimentellen Arbeitsgruppen
- Ein herausragendes, kooperatives und integriertes Forschungsumfeld im Großraum München
- Zugang zu modernen Hochleistungsrechnern