Projektkoordinator*in mit fundierten IT-Kenntnissen
Universität Bielefeld
27 days ago
Role details
Contract type
Temporary contract Employment type
Part-time / full-time Working hours
Shift work Languages
German, EnglishJob location
Tech stack
Java
API
Bioinformatics
Health Informatics
Cloud Computing
Databases
ETL
Relational Databases
Github
R
Laboratory Information Management Systems
Metadata Standards
NoSQL
Vaadin
Workflow Management Systems
GIT
Containerization
Information Technology
Data Management
Software Version Control
Docker
Job description
- Koordination des Arbeitspakets "NUM-OMICs" im Projekt ENRICH inkl. Organisation, Moderation und Dokumentation von Projekttreffen der beteiligten Partner, Sicherstellen des Fortschritts im Projekt, Berichtswesen
- Beteiligung an Arbeitsgruppen zur Definition von Metadatenstandards für OMICs-Daten sowie zur Erarbeitung von Umsetzungskonzepten für FAIR Data Management
- Mitarbeit bei der Erstellung von Datenschutz- und Sicherheitskonzepten für die NUM-OMICs Plattform
- Mitarbeit bei der Definition von API- und Schnittstellenkonzepten sowie von Mapping- und ETL-Prozessen für Analysedaten aus Bioproben
- Unterstützung/Vertretung der IT-Administration der Biobank in Routineaufgaben
Requirements
Das erwarten wir
- erfolgreich abgeschlossenes Hochschulstudium in den Bereichen Bioinformatik, Medizininformatik oder Public Health mit Datenfokus
- alternativ: abgeschlossenes Hochschulstudium der Naturwissenschaften mit Zusatzqualifikation/Kenntnissen im Bereich Informatik/Datenwissenschaften
- erste Kenntnisse im Projektmanagement
- Kenntnisse im Datenmanagement und der FAIR-Prinzipien
- grundlegendes Verständnis für OMICs-Daten sowie Kenntnisse folgender Technologien/Datenarten:
- Genomik
- Transkriptomik
- Microarray-basierte OMICs-Daten
- Verständnis der Architektur von IT-Plattformen und von Schnittstellenkonzepten
- fundierte IT-Kenntnisse, insbesondere
- Workflow-Management-Systeme (z. B. Nextflow, Snakemake)
- Containerisierung (Docker, Singularity)
- Cloud- & HPC-Umgebungen
- ETL-/ELT-Prozesse und Datenpipelines
- Freude an Teamarbeit, Kommunikationsfähigkeit sowie Fähigkeit zum eigenständigen Arbeiten
- hohe Eigenmotivation, Sorgfalt und Zuverlässigkeit
- Gender- und Diversitykompetenz
Das wünschen wir uns
- Erfahrung/Kenntnisse in:
- (akademischen) Verbundprojekten
- Metadatenstandards von OMICs Daten
- Ethik- und Datenschutzthemen
- Java (wünschenswert Erfahrung mit Webframework VAADIN)
- Datenbanken (Relationale Datenbanken / NoSQL)
- Versionskontrolle (z. B. Git) und Kollaboratives Arbeiten: GitHub, GitLabPython
- R (wünschenswert Erfahrung mit: ggplot2, heatmap2, DESeq2)
- Laborinformationsmanagementsystemen (LIMS)
- sehr gute Englischkenntnisse
Benefits & conditions
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Vergütung je nach persönlicher Qualifikation bis zu E13 TV-L
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befristet (mit Verlängerungsoption) bis zum 31.07.2028 (§ 14 Abs. 1 Nr. 1 TzBfG)
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Vollzeit (Teilzeit möglich)
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interne und externe Fortbildungsmöglichkeiten
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Vielzahl von Gesundheits-, Beratungs- und Präventionsangeboten
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Vereinbarkeit von Familie und Beruf
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flexible Arbeitszeiten
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gute Verkehrsanbindung
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betriebliche Zusatzversorgung (VBL)
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kollegiale Zusammenarbeit
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offene und angenehme Arbeitsatmosphäre