Projektkoordinator*in mit fundierten IT-Kenntnissen

Universität Bielefeld
27 days ago

Role details

Contract type
Temporary contract
Employment type
Part-time / full-time
Working hours
Shift work
Languages
German, English

Job location

Tech stack

Java
API
Bioinformatics
Health Informatics
Cloud Computing
Databases
ETL
Relational Databases
Github
R
Laboratory Information Management Systems
Metadata Standards
NoSQL
Vaadin
Workflow Management Systems
GIT
Containerization
Information Technology
Data Management
Software Version Control
Docker

Job description

  • Koordination des Arbeitspakets "NUM-OMICs" im Projekt ENRICH inkl. Organisation, Moderation und Dokumentation von Projekttreffen der beteiligten Partner, Sicherstellen des Fortschritts im Projekt, Berichtswesen
  • Beteiligung an Arbeitsgruppen zur Definition von Metadatenstandards für OMICs-Daten sowie zur Erarbeitung von Umsetzungskonzepten für FAIR Data Management
  • Mitarbeit bei der Erstellung von Datenschutz- und Sicherheitskonzepten für die NUM-OMICs Plattform
  • Mitarbeit bei der Definition von API- und Schnittstellenkonzepten sowie von Mapping- und ETL-Prozessen für Analysedaten aus Bioproben
  • Unterstützung/Vertretung der IT-Administration der Biobank in Routineaufgaben

Requirements

Das erwarten wir

  • erfolgreich abgeschlossenes Hochschulstudium in den Bereichen Bioinformatik, Medizininformatik oder Public Health mit Datenfokus
  • alternativ: abgeschlossenes Hochschulstudium der Naturwissenschaften mit Zusatzqualifikation/Kenntnissen im Bereich Informatik/Datenwissenschaften
  • erste Kenntnisse im Projektmanagement
  • Kenntnisse im Datenmanagement und der FAIR-Prinzipien
  • grundlegendes Verständnis für OMICs-Daten sowie Kenntnisse folgender Technologien/Datenarten:
  • Genomik
  • Transkriptomik
  • Microarray-basierte OMICs-Daten
  • Verständnis der Architektur von IT-Plattformen und von Schnittstellenkonzepten
  • fundierte IT-Kenntnisse, insbesondere
  • Workflow-Management-Systeme (z. B. Nextflow, Snakemake)
  • Containerisierung (Docker, Singularity)
  • Cloud- & HPC-Umgebungen
  • ETL-/ELT-Prozesse und Datenpipelines
  • Freude an Teamarbeit, Kommunikationsfähigkeit sowie Fähigkeit zum eigenständigen Arbeiten
  • hohe Eigenmotivation, Sorgfalt und Zuverlässigkeit
  • Gender- und Diversitykompetenz

Das wünschen wir uns

  • Erfahrung/Kenntnisse in:
  • (akademischen) Verbundprojekten
  • Metadatenstandards von OMICs Daten
  • Ethik- und Datenschutzthemen
  • Java (wünschenswert Erfahrung mit Webframework VAADIN)
  • Datenbanken (Relationale Datenbanken / NoSQL)
  • Versionskontrolle (z. B. Git) und Kollaboratives Arbeiten: GitHub, GitLabPython
  • R (wünschenswert Erfahrung mit: ggplot2, heatmap2, DESeq2)
  • Laborinformationsmanagementsystemen (LIMS)
  • sehr gute Englischkenntnisse

Benefits & conditions

  • Vergütung je nach persönlicher Qualifikation bis zu E13 TV-L

  • befristet (mit Verlängerungsoption) bis zum 31.07.2028 (§ 14 Abs. 1 Nr. 1 TzBfG)

  • Vollzeit (Teilzeit möglich)

  • interne und externe Fortbildungsmöglichkeiten

  • Vielzahl von Gesundheits-, Beratungs- und Präventionsangeboten

  • Vereinbarkeit von Familie und Beruf

  • flexible Arbeitszeiten

  • gute Verkehrsanbindung

  • betriebliche Zusatzversorgung (VBL)

  • kollegiale Zusammenarbeit

  • offene und angenehme Arbeitsatmosphäre

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