Daten- und IT-Manager*in für Omics-Daten

Universität zu Köln
Köln, Germany
15 days ago

Role details

Contract type
Permanent contract
Employment type
Full-time (> 32 hours)
Working hours
Shift work
Languages
German, English

Job location

Köln, Germany

Tech stack

Data analysis
Bioinformatics
Unix
Linux
File Systems
Python
Data Classification
Deep Learning
Information Technology

Job description

  • Entwurf und Umsetzung standardisierter Ordnerhierarchien und Namenskonventionen für alle HPC-Speichersysteme
  • gemeinsame Umsetzung von Standardarbeitsanweisungen für die Datenanalyse, Softwareentwicklung und Datenanalyse-Pipelines, einschließlich für maschinelles Lernen und Deep Learning
  • Entwicklung und Pflege von Metadatenschemata zur Ermöglichung einer effizienten Datenermittlung, -abruf und eines Datenlebenszyklusmanagements
  • Erstellung und Durchsetzung von Richtlinien zur Datenorganisation und Best Practices für Forschungsteams
  • Implementierung von Quotenmanagement und Zusammenarbeit mit Anwendern zur Optimierung der Speichereffizienz
  • Beratung von Forschenden zu Best Practices der Datenorganisation
  • Erstellung von Dokumentationen, Vorlagen und Standardarbeitsanweisungen

Requirements

  • Bachelor- oder Masterabschluss in Informatik, Bioinformatik oder einem IT-nahen Studienfach
  • fundierte Erfahrung mit Linux-/Unix-Befehlszeilenumgebungen
  • Vertrautheit mit HPC-Speicherarchitekturen und parallelen Dateisystemen
  • ausgeprägte Detailgenauigkeit und systematische Herangehensweise an die Datenklassifizierung
  • Verständnis für wissenschaftliche Forschungsabläufe und Datentypen
  • ausgezeichnete Kommunikationsfähigkeiten für die Zusammenarbeit mit unterschiedlichen technischen und nicht-technischen Anwendern
  • sehr gute Kenntnisse in Python und R für die Datenanalyse
  • Vertrautheit mit Tools wie samtools und Nextflow
  • sehr gute zwischenmenschliche und kommunikative Fähigkeiten; insbesondere die Fähigkeit, effektiv in einem vielfältigen, kooperativen und interdisziplinären Forschungsumfeld zu arbeiten
  • sehr gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift sind unbedingte Voraussetzung

Benefits & conditions

  • die Möglichkeit, sich in modernsten Bioinformatik-Methoden, einschließlich Deep Learning, im Bereich Genomdaten weiterzubilden
  • ein vielfältiges und chancengerechtes Arbeitsumfeld
  • Unterstützung bei der Vereinbarkeit von Beruf und Familie
  • flexible Arbeitszeitmodelle
  • ein umfangreiches Weiterbildungsangebot
  • Angebote im Rahmen des Betrieblichen Gesundheitsmanagements, Die Stelle ist ab 01.07.2026 oder zum frühest möglichen Zeitpunkt in Vollzeit (39,83 Wochenstunden) zu besetzen. Sie ist unbefristet. Sofern die entsprechenden tariflichen und persönlichen Voraussetzungen vorliegen, richtet sich die Vergütung nach der Entgeltgruppe 11 TV-L.

About the company

Wir sind eine der größten und ältesten Universitäten Europas und gehören zu den größten Arbeitgeber*innen in unserer Region. Durch unser breites Fächerspektrum, die dynamische Entwicklung unserer Forschungsschwerpunkte und unseren Standort mitten in Köln sind wir attraktiv für Studierende und Forschende weltweit. Wir bieten vielfältige Karrierechancen in Wissenschaft, Technik und Verwaltung. Die Poetsch-Gruppe sucht eine*n Daten- und IT-Manager *in, die*der das Team bei der Erforschung von Genomen und deren Veränderungen im Alter sowie bei der Entstehung von Krebs unterstützt. Der Schwerpunkt der Stelle liegt auf der gemeinsamen Entwicklung einer Infrastruktur zur Datenanalyse im Bereich Hochleistungsrechnen mit Omics-Daten.

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