Data Steward / Bioinformatikerin

German Human Genome - Phenome Archive (GHGA)
Heidelberg, Germany
7 days ago

Role details

Contract type
Permanent contract
Employment type
Part-time (≤ 32 hours)
Working hours
Shift work
Languages
German, English

Job location

Heidelberg, Germany

Tech stack

Bioinformatics
Unix
Cloud Computing
Computational Biology
Data Security
Electronic Data Interchange (EDI)
JSON
Python
Metadata
Software Engineering
Data Processing
Data Ingestion
Information Technology
Data Management

Job description

Infrastruktur Informatik UNIX Datenverarbeitung Python Datensicherheit Datenverwaltung Bioinformatik Programmiersprachen JSON Cloud Computing Ingenieurwissenschaften Datenschutz Kommunikationsfähigkeit Eigenmotivation, * Sie stehen in engem Austausch mit Forscher:innen als Datenlieferanten und Nutzern, beraten diese zu Anforderungen, Prozessen sowie zu legalen und technischen Abläufen im Datenmanagement.

  • Sie koordinieren und moderieren die täglichen Prozesse rund um das Datenmanagement im GHGA-Datenportal und im Genomrechenzentrum für das Modellvorhaben Genomsequenzierung.
  • Sie identifizieren geeignete Forschungsdatensätze und bewerten deren Potenzial für den Datenaustausch.
  • Sie führen Qualitätskontrollen durch und bereiten Forschungsdaten und Metadaten für die Aufnahme in GHGA und das Modellvorhaben Genomsequenzierung vor.
  • Sie entwickeln und implementieren Standard Operating Procedures (SOPs) für den Umgang mit humanen Genomdaten und anderen Omics-Daten.
  • Sie gestalten Strategien und Prozesse für Datenaufnahme, Metadatenvalidierung und Qualitätssicherung aktiv mit.
  • Sie bearbeiten Datenzugriffsanfragen und koordinieren die dazugehörigen administrativen und rechtlichen Abläufe.
  • Sie verfolgen aktuelle Entwicklungen im Bereich des wissenschaftlichen Datenmanangement sowie sicherer Datenverarbeitung und -freigabe und bringen Ihr Wissen in internationale Kooperationen ein. Sie tragen dazu bei, eine der zentralen wissenschaftlichen Dateninfrastrukturen für die biomedizinische Forschung in Deutschland mit aufzubauen - und gestalten aktiv, wie Genomdaten künftig genutzt werden können.

Requirements

  • Ein abgeschlossenes Masterstudium (ggf. mit Promotion) in Bioinformatik, Computational Biology, Biowissenschaften, Informatik, Physik, Mathematik, Ingenieurwissenschaften oder einem verwandten Bereich
  • Erfahrung in der Entwicklung oder Umsetzung von Datenmanagement- bzw. Datenkuratierungskonzepten
  • Kenntnisse in der Arbeit mit humanen Omics-Daten
  • Kenntnisse in der Umsetzung von Maßnahmen zum Datenschutz (DSGVO) und Datensicherheit sind von Vorteil
  • Sicherer Umgang mit UNIX-basierten Systemen und Programmiersprachen, insbesondere Python
  • Erfahrung mit der Modellierung von Metadaten (z. B. LinkML, JSON Schema) ist von Vorteil
  • Kenntnisse in Softwareentwicklung und Cloud-Computing-Umgebungen sind wünschenswert
  • Freude an interdisziplinärer Zusammenarbeit, gute Kommunikationsfähigkeiten im Deutschen (C1-Level) und im Englischen und ein selbstständiger, lösungsorientierter Arbeitsstil

Benefits & conditions

Gesundheitsförderung Entwicklungsmöglichkeiten Firmenticket Betriebliche Altersvorsorge Mobiles Arbeiten Flexible Arbeitszeiten Zusätzliche Urlaubstage Weiterbildungsmaßnahmen, * Hervorragende Rahmenbedingungen: modernste state-of-the-art Infrastruktur und Möglichkeit zum internationalen Austausch auf Spitzenniveau

  • 30 Tage Urlaub
  • Flexible Arbeitszeiten
  • Vergütung nach TV-L inkl. betrieblicher Altersvorsorge und vermögenswirksamer Leistungen
  • Möglichkeit zur mobilen Arbeit und Teilzeitarbeit
  • Familienfreundliches Arbeitsumfeld
  • Nachhaltig zur Arbeit: Vergünstigtes Deutschland-Jobticket

About the company

Das German Human Genome-Phenome Archive () in Heidelberg ist Teil der Nationalen Forschungsdateninfrastruktur () und sorgt dafür, dass sensible Human-Genomdaten sicher, FAIR und effizient für die Forschung zugänglich werden. Darüber hinaus sind wir Teil der nationalen Initiative (Nationales Modellvorhaben Genomsequenzierung) und arbeiten eng mit europäischen und internationalen Partnern wie der Global Alliance for Genomics and Health () und dem European Genome-Phenom Archive (EGA) zusammen.GHGANFDIgenom.DEGA4GH, * Chance, eine zentrale Dateninfrastruktur der biomedizinischen Forschung in Deutschland mitzugestalten * Zusammenarbeit mit internationalen Partnern (z. B. GA4GH, EGA) in einem dynamischen Umfeld * Gestaltungsspielraum und ein Team, das Innovation und Eigeninitiative schätzt * Vielfältige Weiterbildungs- und Entwicklungsmöglichkeiten durch Seminare, Schulungen und Konferenzen

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