Spécialiste en gestion de données biomédicales au sein de la DSBU
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Job description
La Data Stewardship Biomed Unit (DSBU) accompagne les chercheur-euse-s de la Faculté de biologie et médecine de l'UNIL et du CHUV dans la gestion, le partage et la préservation des données de recherche, conformément aux principes FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable) et aux exigences nationales et internationales en matière d'Open Research Data (ORD). Au sein d'une équipe spécialisée, vous contribuez au développement de solutions favorisant l'interopérabilité, l'automatisation et la valorisation des données biomédicales, avec un focus particulier sur les domaines de la génomique et de la transcriptomique. Mission
- Vous participez à la mise en œuvre d'une gestion avancée des données de recherche en génomique et transcriptomique, conformément aux standards FAIR, aux exigences de l'Open Research Data (ORD) et aux recommandations internationales du domaine
- Vous assurez un service de conseil personnalisé et animez des formations destinées aux chercheur-euse-s de la FBM UNIL/CHUV afin d'harmoniser le partage et la préservation des (méta)données de recherche
- Vous développez des scripts et automatisez les processus afin de garantir la cohérence et l'interopérabilité des données et métadonnées à grande échelle
- Vous développez des applications, des interfaces et des bases de données permettant d'intégrer différents outils de gestion des données dans les environnements informatiques de la FBM, du CHUV et de partenaires externes.
Requirements
- Vous êtes titulaire d'un doctorat en sciences de la vie
- Vous justifiez d'une expérience d'au moins 4 ans en recherche en biologie ou biologie médicale, associée à une pratique avancée de la gestion de données en génomique et transcriptomique
- Vous possédez une solide maîtrise de Python, UNIX, bash et git
- Vous disposez de compétences avérées en développement web, en gestion de bases de données et dans l'utilisation d'API
- Vous maîtrisez le français et l'anglais, tant à l'oral qu'à l'écrit
- Vous faites preuve d'un excellent sens de l'organisation et respectez les délais
- Vous êtes reconnu-e pour votre autonomie, votre pédagogie et votre sens du service.
Benefits & conditions
Devenir une collaboratrice ou un collaborateur du Centre hospitalier universitaire vaudois, c'est l'assurance de bénéficier:
- De prestations sociales de premier ordre, d'un congé paternité de 20 jours et d'un congé maternité de 4 mois (avec possibilité d'un mois supplémentaire de congé d'allaitement)
- D'une progression salariale régulière et adaptée aux responsabilités
- D'un 13ème salaire et de 25 jours de vacances par année
- D'un droit à trois jours de formation minimum par année, avec l'accès à une offre variée au sein du Centre des Formations du CHUV et des centres de formation partenaires de l'Etat de Vaud