Data Engineer - Python - H/F

CENTRE LEON BERARD
Lyon, France
6 days ago
Apply on www.staffsante.fr
Prepare application

Role details

Contract type
Permanent contract
Employment type
Full-time (> 32 hours)
Experience level
Starter
Experience required
2 years minimum
Compensation
€40,000.0 - €50,000.0
Working hours
Regular working hours
Languages
English

Tech stack

Microsoft Windows Airflow Data Analysis Big Data Information Systems Databases Continuous Integration Extract Transform Load (ETL) Linux DevOps Dicom Python (Programming Language)
+8 more
Machine Learning SQL Databases Data Server Interface Gitlab Information Technology Code Restructuring Data Pipelines Docker

Job description

Rendre exploitable (extraire l’information utile) une grande quantité de données disponible Élargir le périmètre des données interconnectées, structurées et requêtables À plus long terme, la création d’un gisement de données multi-sources, réparti et accessible pour les cliniciens et les chercheurs, basé sur le modèle de données OSIRIS.

Organisation :

Vous êtes rattaché hiérarchiquement au Directeur des Systèmes d’Information et à la Responsable de la Data Factory, et êtes en lien très fort avec les équipes scientifiques, porteuses de projet. L’équipe Data Factory est une des trois équipes de la DSI avec l’équipe de développement/projet et l’équipe infrastructure. Elle est dédiée à la mise en œuvre et au pilotage de projets de réutilisation de données massives (Big Data). Elle permet l’extraction et le traitement de données des données de santé à destination des projets de recherche clinique ou des industriels.

Au sein de la Data Factory, vous participez :

  • Au développement, à la maintenance, à l’optimisation et à l’industrialisation des ETL, en Python. Ces traitements permettent de structurer, nettoyer et standardiser des données hétérogènes issues de multiples sources (bases de données, fichiers plats, exports spécifiques, etc.) pour les rendre conforme aux standards/ format cible OSIRIS et OSIRIS RWD,des scripts python pour rendre interopérables des systèmes entre eux, manipuler des sources de données spécifiques (DICOM d’imagerie, lames numérisées d’anatomopathologie…),
  • A l’automatisation et l’industrialisation des traitements data (ETL, algorithme IA ou brique CI/CD) de l’équipe,
  • A la maintenance et l’étoffement de l’outillage interne de l’équipe avec l’appui du architecte logiciel de l’équipe projet,
  • Aux réflexions, spécifications, installations et mises à jour des infrastructures / logiciels / architectures spécifiques aux projets de recherche avec l’appui des équipes d’infrastructure., Vous êtes amené à :
  • Réaliser des analyses des structures et format de données,
  • Réaliser l’analyse technique (architecture, choix des composants, prototypage, compatibilité avec les technologies existantes) dans le respect des bonnes pratiques d’infrastructure et de cybersécurité
  • Contribuer à la documentation,
  • Être le relai auprès de l’architecte logiciel sur les aspects développement et outillage,
  • Être le relai de l’équipe infrastructure sur les aspects systèmes des projets., Le soin : nos équipes soignantes prennent en charge plus de 42.000 patients par an, avec des soins personnalisés et innovants

  • La recherche : nos chercheurs et médecins travaillent main dans la main, couvrant les domaines de la recherche fondamentale, translationnelle et clinique

  • L’enseignement : chaque année, nous assurons la diffusion des savoirs et formons nos collaborateurs et des professionnels extérieurs

Au Centre Léon Bérard, nous vous proposons :

  • En moyenne, 25 jours de récupération par an (en plus de 5 semaines de congés payés)

  • La possibilité d’alimenter un Compte Epargne Temps (CET).

  • Une carrière évolutive avec un accompagnement et des formations adaptés.

  • Une mutuelle qui couvre l’ensemble de la famille, y compris le (la) conjoint(e), sans surcoût.

  • Une crèche d’entreprise, un self, un comité d’entreprise de proximité, un accès à notre salle de sport, un plan vélo, etc.

Faites LA DIFFERENCE, en choisissant un TRAVAIL DIFFERENT !, Accomplir un travail qui compte et où chacun compte.

  • Vivre au quotidien des expériences enrichissantes.

  • Travailler avec plaisir au sein d’une communauté à l’ambiance conviviale.

  • Construire votre parcours et grandir dans une structure apprenante.

  • Concilier « vivre et travailler ».

Requirements

Féru de code, vous avez un attrait pour l’acquisition de compétences et êtes curieux des évolutions techniques dans votre domaine. Vous avez une appétence pour les sujets devops. Vous saurez également être force de proposition et en mesure de faire évoluer ces propositions, au regard des exigences des équipes qui vous entoure. Vous êtes doté d’un bon sens relationnel et faites preuve de rigueur, d’organisation et d’autonomie. Vous avez le goût du travail en équipe et communiquez aisément. Vous avez un intérêt pour la compréhension d’un projet dans son ensemble et savez traduire cela dans la priorisation de vos tâches.

Diplôme et compétences :

  • Diplôme d’une grande Ecole d’Ingénieur et/ou d’un 3ème cycle universitaire spécialisé en Informatique. 3-4 ans d’expérience (alternance acceptée), idéalement dans le domaine des data en santé, (dont 1 an sur les aspects devops) souhaitée.

  • Connaissances générales en informatique et en data.
  • Connaissance système serveur Windows et Linux.
  • Maitrise en développement python (optimisation, refactoring de code…) en contexte big data.
  • Bonnes connaissances en industrialisation et automatisation.
  • Connaissance des ETL/ELT, construction de pipeline de données et requêtage SQL.
  • Connaissance des outils Airflow et GitLab (ou équivalent).
  • Capacité à appréhender des enjeux liés à la recherche, à l’analyse de données et aux technologies de machine learning, notamment dans le domaine de la santé (santé publique, génétique, épidémiologie, etc.)
  • Niveau anglais technique obligatoire, pour échanger avec les partenaires internationaux.

Sont un plus :

  • Connaissance du milieu de la recherche en santé -Connaissance Docker

Si vous êtes tenté par une expérience où vous allierez épanouissement professionnel et travail “utile”, au bénéfice de l’amélioration de la prise en charge de nos patients, alors rejoignez nous !, Débutant (moins de 2 ans), Expérimenté (2 à 5 ans), Confirmé (5 ans et plus)

Diplôme d’une grande Ecole d’Ingénieur et/ou d’un 3ème cycle universitaire spécialisé en Informatique.

Benefits & conditions

Entre 40000 € et 50000 € (bruts/an)

Reprise d’ancienneté, Crèche, Formation

Les “petits plus” qui font la différence

En moyenne, 25 jours de récupération par an (en plus de 5 semaines de congés payés).

Reprise d’ancienneté

Chèques cadeaux

Chèques vacances

Formation

Place en crèche

Primes

Restauration d’entreprise

Plan épargne

Prise en charge des transports

Mutuelle

  • 7 Avantages

  • 7 Avantages, Rémunération annuelle brute à partir de 40k€ par an + reprise d’expérience (selon barème) + prime sur objectifs.

Statut cadre, au forfait jours.

About the company

Dans le cadre d’un remplacement, nous recrutons pour renforcer notre Data Factory : Data Engineer - Python (F/H) - CDI - temps plein - à pourvoir à compter de septembre 2026.

LE PROJET :

Le CLB est impliqué dans des projets d’intelligence artificielle depuis plusieurs années avec des partenariats académiques et industriels. Ces projets bénéficient de notre importante base de données de plus de 340 000 patients dans un dossier patient développé en interne et qui a été progressivement informatisé depuis 1993.

Depuis quelques années, le CLB s’est engagé dans des projets intégrant l’Intelligence Artificielle (IA) et les Big Data en santé. Les prérequis à l’utilisation des données de santé et l’intégration de l’IA en routine est la disponibilité de données structurées et de qualité. C’est devant cette nécessité que la Data Factory a été créée en 2021, dont les objectifs sont de structurer et fiabiliser les données, ce qui implique notamment, Centre Léon Bérard

Le Centre Léon Bérard (#CLB), membre de la fédération Unicancer, est LE pôle de référence régional en cancérologie. Regroupant 2.300 collaborateurs sur un site unique à Lyon 8ème, nous sommes à la fois un hôpital et un centre de recherche., Un « plan vélo », participation financière à l’achat et l’accès à parking à vélos sécurisé

Apply for this position

This job is hosted externally. Click below to view the full posting and apply.

Apply on www.staffsante.fr
Prepare application

Good distractions

Talks and stories from around this role — technically off-topic, practically not.

3:30 min

Scaling agile frameworks and data interoperability in healthcare

Leo Lindhorst · World Congress 2022

2:07 min

Inspecting default bridge architectures and custom Docker networks

Oliver Seitz Oliver Seitz · World Congress 2025

52 sec

Running persistent Linux environments directly on Windows

Ben Breard Ben Breard · World Congress 2025

1:34 min

Bringing diverse skills to industrial data science roles

Katja Träumner

2:34 min

Docker sandbox architecture and microVM environment integration

Manuel de la Peña Manuel de la Peña · World Congress 2026 Europe

3:55 min

Demonstrating .NET installation on Debian and Azure Linux

Silvano Coriani Silvano Coriani · Europe 2026 Virtual

Videos

See all

Related articles

See all