Data Scientist

Universitätsklinikum Bonn
Bonn, Germany
23 days ago
Apply on de.indeed.com
Prepare application

Role details

Contract type
Permanent contract
Employment type
Full-time (> 32 hours)
Working hours
Shift work
Languages
English, German
Job source

Tech stack

Data Analysis Python (Programming Language) Management of Software Versions Information Technology Software Version Control

Job description

  • Eigenständige Konzeption, Durchführung und kontinuierliche Weiterentwicklung bioinformatischer Analysepipelines für Omics-Daten (z. B. RNA-Seq, scRNA-Seq, multimodale Ansätze), insbesondere in der Immunologie und Tumorbiologie
  • Entwicklung und Anwendung statistischer Methoden sowie maschineller Lernverfahren zur Analyse komplexer biologischer Hochdurchsatzdaten
  • Sicherstellung der Reproduzierbarkeit und Qualität wissenschaftlicher Analysen durch den Einsatz von Versionskontrolle, dokumentierten Workflows und etablierten Best Practices
  • Mitwirkung an der Erstellung wissenschaftlicher Publikationen in internationalen Fachzeitschriften, insbesondere in den Bereichen Datenanalyse, Methodik und Ergebnisdarstellung
  • Organisation, inhaltliche Weiterentwicklung und jährliche Durchführung des LSI-Kurses “Mathematical Modelling of Immune Cell Dynamics”
  • Fachliche Anleitung und methodische Unterstützung von Doktoranden und Masterstudierenden im Rahmen laufender Forschungsprojekte
  • Koordination und Pflege von Kooperationen mit nationalen und internationalen Forschungspartnern sowie Unterstützung interdisziplinärer Projekte
  • Eigenständige Konzeption und Ausarbeitung von Drittmittelanträgen einschließlich Mitwirkung an Projektplanung, Monitoring und Berichterstattung

Requirements

  • Abgeschlossenes Studium (Bachelor/Master) im Bereich Biowissenschaften sowie Promotion im Bereich Mathematik und/oder Informatik
  • Kenntnisse im Bereich Immunologie und zielgerichtete Krebstherapie sowie die Bereitschaft zur stetigen Fortbildung zu modernen Methoden in der Tumorimmunologie
  • Fundierte und eigenständige Erfahrung in der Konzeption, Durchführung und Weiterentwicklung bioinformatischer Analysepipelines für Omics-Daten
  • Ausgeprägte Expertise in der Analyse komplexer Hochdurchsatzdaten sowie im Einsatz statistischer Methoden und maschineller Lernverfahren
  • Erfahrung in der Entwicklung und Implementierung neuer bioinformatischer Methoden sowie in der Integration multimodaler Datensätze (z. B. scRNA-seq, Spatial Omics)
  • Sehr gute Programmierkenntnisse in R und Python, insbesondere im Kontext reproduzierbarer Datenanalyse, Workflow-Entwicklung und strukturierter Projektorganisation
  • Sicherer Umgang mit Unix/Linux-basierten Systemen und Hochleistungsrechnern (HPC), einschließlich skalierbarer Datenanalyse und effizienter Workflow-Optimierung
  • Erfahrung im Aufbau und der nachhaltigen Betreuung von Rechenumgebungen, einschließlich Dependency Management und Workflow-Automatisierung
  • Vertrautheit mit Best Practices der reproduzierbaren Forschung, Versionierung und strukturierter Dokumentation wissenschaftlicher Analysen
  • Erfahrung in der Mitwirkung an wissenschaftlichen Publikationen in internationalen Fachzeitschriften sowie im wissenschaftlichen Schreiben in englischer Sprache
  • Erfahrung in der fachlichen Anleitung und Unterstützung von Nachwuchswissenschaftler*innen sowie in der Koordination interdisziplinärer Projekte
  • Erfahrung in der Konzeption und Ausarbeitung von Drittmittelanträgen sowie aktive Beteiligung an Projektentwicklung, Monitoring und Berichterstattung
  • Erfahrung in der Organisation und Durchführung von Lehrveranstaltungen, einschließlich eigenständiger Lehre und Betreuung von Studierenden
  • Sehr gute Kommunikations- und Präsentationsfähigkeiten sowie Erfahrung in der Zusammenarbeit mit nationalen und internationalen Forschungspartnern
  • Selbstständige, proaktive und strukturierte Arbeitsweise mit hoher organisatorischer Kompetenz
  • Fließende Deutsch- und Englischkenntnisse in Wort und Schrift

Benefits & conditions

BEZAHLUNG NACH TV-L

BEZAHLUNG NACH TV-L

Tarifliche und leistungsgerechte Vergütung nach TV-L / TV-Ä an Universitätskliniken (inkl. Zusatzleistungen wie Jahressonderzahlungen), Attraktives Ausbildungsgehalt, planbare 38,5 Stunden-Woche, 30 Tage Tarifurlaub mit zusätzlich 2 Zusatzurlaubstagen (TV-E), sehr gute Übernahmechancen nach der Ausbildung, ein Ausbildungsplatz in einem kollegialen Team mit strukturierter Einarbeitung

About the company

Das UKB verbindet als eines der leistungsstärksten Universitätsklinika Deutschlands Höchstleistungen in Medizin und Forschung mit exzellenter Lehre. Jährlich werden am UKB über eine halbe Million Patienten ambulant und stationär versorgt. Hier studieren rund 3.500 Menschen Medizin und Zahnmedizin, zudem werden jährlich über 600 Personen in Gesundheitsberufen ausgebildet. Mit rund 9.900 Beschäftigten ist das UKB der drittgrößte Arbeitgeber in der Region Bonn/Rhein-Sieg. In der Focus-Klinikliste belegt das UKB Platz 1 unter den Universitätsklinika in NRW und weist unter den Universitätsklinika bundesweit den zweithöchsten Case-Mix-Index (Fallschweregrad) auf. 2024 konnte das UKB knapp 100 Mio. € an Drittmitteln für Forschung, Entwicklung und Lehre einwerben. Das F.A.Z.-Institut zeichnete das UKB im vierten Jahr in Folge als “Deutschlands Ausbildungs-Champion” und “Deutschlands begehrtesten Arbeitgeber” aus., Am UKB arbeiten Sie an einem Krankenhaus der Zukunft. Mit einer Jahresbilanz von 1,6 Mrd. im Jahre 2023, einem Jahresüberschuss von über 21 Millionen Euro und dem dritthöchsten Case Mix Index in Deutschland ist das UKB glänzend für die Zukunft aufgestellt

Apply for this position

This job is hosted externally. Click below to view the full posting and apply.

Apply on de.indeed.com
Prepare application

Good distractions

Talks and stories from around this role — technically off-topic, practically not.

42 sec

Energy forecasts and resource demands of information technology

Marjolein Pordon · LIVE

1:48 min

Automating exploratory data analysis within training pipelines

Dora Petrella · World Congress 2023

4:36 min

Managing policies exactly like standard software dependencies

Chris Nesbitt-Smith · LIVE

2:47 min

Exploring career opportunities and recruitment open positions

Kurt Eder · LIVE

2:48 min

Integrating version control and AI into productivity software

2:35 min

Analyzing current and future IT talent shortages in Germany

Ingolf Teetz Ingolf Teetz · World Congress 2024

Videos

See all

Related articles

See all