Datenwissenschaftler_in

Helmholtz Centre for Infection Research GmbH
Braunschweig, Germany
12 days ago

Role details

Contract type
Temporary contract
Employment type
Full-time (> 32 hours)
Working hours
Regular working hours
Languages
English

Tech stack

Data Analysis Bioinformatics Computational Biology Python (Programming Language)

Job description

  • Analyse und Interpretation von Whole-Genome-Sequencing-(WGS)-Daten aus einer bevölkerungsbasierten Kohorte (NAKO)
  • DurchfĂŒhrung genetisch-epidemiologischer Analysen (z. B. GWAS, Rare-Variant-Analysen, Burden-Tests, Mendelian Randomization)
  • Integration von Multi-Omics-Daten (z. B. Transcriptomics, Proteomics)
  • Statistische Modellierung zur Identifikation genetischer Risikofaktoren komplexer Erkrankungen / ZustĂ€nde wie z.B. Reinfektionen, InfektionsanfĂ€lligkeit
  • Mitarbeit an Drittmittelprojekten sowie Publikation der Ergebnisse in internationalen Fachzeitschriften
  • PrĂ€sentation der Ergebnisse auf nationalen und internationalen Konferenzen
  • Zusammenarbeit mit interdisziplinĂ€ren Teams aus Epidemiologie, Bioinformatik und Molekularbiologie

Requirements

  • Abgeschlossenes wissenschaftliches Hochschulstudium (Master oder Promotion) in Genetik, Bioinformatik, Epidemiologie, Biostatistik, Computational Biology oder verwandten Disziplinen
  • Erfahrung in der Analyse von WGS-Daten nachgewiesen durch z.B. eine Publikation
  • Fundierte Kenntnisse in statistischer Genetik und populationsbasierter Datenanalyse
  • Sehr gute Programmierkenntnisse (z. B. R, Python)
  • Erfahrung mit gĂ€ngigen Tools und Frameworks (z. B. PLINK)
  • Kenntnisse im Umgang mit Hochleistungsrechnern (HPC) / Clustern
  • Sehr gute Englischkenntnisse in Wort und Schrift
  • SelbststĂ€ndige, strukturierte Arbeitsweise und TeamfĂ€higkeit

Vorteilhaft fĂŒr diese Stelle:

  • Erfahrung mit großen KohortendatensĂ€tzen
  • Erfahrung in seroepidemiologischen Studien sowie Studien zu respiratorischen Infektionskrankheiten
  • Erfahrung in der statistischen Betreuung von epidemiologischen/medizinischen Studien, Promotions- und Masterarbeiten
  • Erfahrung in der Einwerbung von Drittmitteln

Benefits & conditions

  • VielfĂ€ltige Weiterbildungsmöglichkeiten (vor Ort Teilnahme an Seminaren des PhD-Studiengangs “Epidemiology”)
  • Möglichkeit zur Habilitation
  • Eine attraktive und abwechslungsreiche TĂ€tigkeit in einem zukunftsorientierten Forschungsinstitut mit einem internationalen Umfeld am Science Campus SĂŒd in Braunschweig
  • Eine hochmoderne Infrastruktur und modernste Technologien
  • Flexible Arbeitszeitgestaltung, Teilzeitmodelle sowie Homeoffice
  • Eine Unternehmenskultur der WertschĂ€tzung und Förderung der Chancengleichheit
  • Umfangreiche Fort- und Weiterbildungsmöglichkeiten zur Entwicklung fachlicher Kenntnisse und persönlicher FĂ€higkeiten
  • Ein FamilienbĂŒro zur UnterstĂŒtzung von Familie und Beruf, sowie Angebote fĂŒr eine verbesserte Kinderbetreuung bspw. auch in den Ferien
  • Interessante Zusatzleistungen des öffentlichen Dienstes
  • Möglichkeit eines Arbeitgeberzuschusses zum Jobticket

About the company

Das Helmholtz-Zentrum fĂŒr Infektionsforschung mit Sitz in Braunschweig, betreibt als Mitglied der Helmholtz-Gemeinschaft Spitzenforschung auf dem Gebiet der Infektionskrankheiten. Unsere Wissenschaftler_innen entwickeln neuartige Methoden und Strategien, um Infektionskrankheiten immer schneller und wirksamer bekĂ€mpfen zu können. Unser gemeinsames Ziel sind neuartige AnsĂ€tze zur PrĂ€vention, Diagnose und Therapie von Infektionskrankheiten. Im Zentrum unserer Forschung stehen bakterielle und virale Krankheitserreger, ihr Wechselspiel mit dem Immunsystem des Menschen und neue wirksame Wirkstoffe und Vakzine.

Die Abteilung fĂŒr Epidemiologie beschĂ€ftigt mehr als 40 Mitarbeitende (www.helmholtz-hzi.de/epidemiologie). Unsere Forschung konzentriert sich auf die grundlegenden ZusammenhĂ€nge zwischen dem Auftreten, der Ausbreitung und der PrĂ€vention von Infektionskrankheiten in der menschlichen Bevölkerung auf nationaler und internationaler Ebene. Im Rahmen der NAKO-Gesundheitsstudie(www.nako.de) arbeiten wir im Bereich Immunologie und Infektion. Zur Infrastruktur der Abteilung gehört auch das Promotionsprogramm “Epidemiologie”.

Die Stelle wird im Rahmen der Sequenzierung von NAKO-Teilnehmenden ausgeschrieben. Der Fokus des Projektes liegt auf der Analyse qualitĂ€tsgesicherter Whole-Genome-Sequencing Daten von NAKO Teilnehmenden als Teil der zu analysierenden Expositionen im Zusammenhang mit Infektionsevents, serologischen und weiteren infektionsrelevanten omics-Daten sowie anderen Infektionsoutcomes. Das Projekt bietet einen hochwertigen, phĂ€notypisch umfassend charakterisierten Genomdatensatz von mehreren 10.000 Personen. Es ermöglicht eine Vielzahl von Analysen - von der Populationsgenetik bis hin zur Erforschung von KrankheitszusammenhĂ€ngen - und legt den Grundstein fĂŒr zukĂŒnftige Entdeckungen in der Humangenomik und der PrĂ€zisionsmedizin.

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